Tazmanya kaplanı, nesli tükenmesine rağmen RNA’sı çıkarılan ilk canlı oldu

İsveçli bir ekip tarafından özel olarak geliştirilmiş bir yöntemle, bir Tazmanya kaplanınına (Thylacine) ait 132 yıllık deri ve kas örneğinden milyonlarca RNA ipliği çıkarmayı başardı.

Bilim insanları tarafından Thylacinus cynocephalus olarak adlandırılan bu çizgili, etobur canlı 1930'lu yıllarda Avustralya'nın Tazmanya adasında avlanarak yok edildi.

Geliştirilen yöntemin potansiyeli çok büyük!

RNA kısaca, DNA'da kodlanan bilgiyi proteinlere çeviren genetik materyaldir. Tazmanya kaplanı gibi soyu tükenmiş hayvanlardan RNA çıkarmayı başarmak, uzun süredir kayıp olduğu düşünülen genler hakkında bir bilgi hazinesinin kapılarını arayabilir.

Stockholm Üniversitesi'nde Biyoinformatik uzmanı olan Emilio Mármol-Sánchez ve ekip arkadaşları, yayınladıkları makalede, “Artık canlı hücrelerde bulunmayan RNA’nın geri kazanılması, soyu tükenmiş hayvanların biyolojisini araştırma potansiyelini büyütüyor” diye konuştu.

Stockholm Üniversitesi'ndee Moleküler Biyolog olan Marc Friedländer ise şunları söyledi; “İlk kez, mikroRNA'lar gibi, bir yüzyıldan daha uzun bir süre önce soyu tükenmiş olan Tazmanya kaplanlarına özgü düzenleyici genlerin varlığına dair bir fikir edindik.”

DNA dizilerini okumak bize bir türün hangi genlere sahip olduğunu söylerken, RNA dizileri hangi genlerin aslında 'açık' olduğunu ve hücrelerin içinde protein yapmak için kullanıldığını ortaya koyar. Ancak RNA çok daha hassastır ve DNA'dan çok daha hızlı bozulur. Bu nedenle eski örnekleri kurtarmak zordur… Ancak imkansız değildir.

Tazmanya kaplanının bilgisayar ortamında oluşturulan görüntüsü

Çalışma nasıl yapıldı?

Mármol-Sánchez ve meslektaşları, 1891 yılında kataloglanan ve Stockholm'deki Doğa Tarihi Müzesi'nde rafa kaldırılan bir Tazmanya kaplanı örneğinden 6 kas ve deri örneği aldı.

Bu 132 yaşındaki Tazmanya kaplanı’ndan elde edilen RNA, kurtarılan en eski RNA değil. Kısa bir süre önce yaklaşık 14.300 yıldır donmuş toprakta muhafaza edilen köpek benzeri bir kanidden ve 5.300 yıllık mumyalanmış bir buz adamdan RNA elde edildi.

Ancak antik kurdun net bir taksonomik derecesi yoktur ve ailesi günümüzde yaşamaktadır. Bu da Tazmanya kaplanının RNA'sı, geri kazanılan ilk gerçek soyu tükenmiş hayvan olduğu anlamına geliyor.

RNA'sının bir kısmı, yüzlerce ya da binlerce yıl boyunca korunduğunda ya da mumyalama kimyasalları kullanıldığında beklenen hasar belirtileri gösteriyor. Örnekler insan ve muhtemelen bakteri RNA'sı ile de kontamine olmuş olabiliyor. Ancak araştırmacılar Tazmanya kaplanı RNA dizilerinin gerçekliğini türün genomuyla eşleştirerek doğrulamayı başardı.

Araştırmadan elde edilen sonuçlar Genome Research dergisinde yayınlandı.